Politeknik Keuangan Negara memliki 4 jurusan, yaitu:
- Jurusan Akuntansi
- Jurusan Pajak
- Jurusan Kepabeanan dan Cukai
- Jurusan Manajemen Keuangan
Masing-masing jurusan dipimpin oleh Ketua Jurusan.
1. AKUNTANSI
Jurusan Akuntansi Politeknik Keuangan Negara (PKN) STAN dipimpin oleh Ketua Jurusan. Jurusan Akuntansi memiliki 2 (dua) Program Studi unggulan, yaitu :
- Program Studi Diploma Empat (IV) Akuntansi; dan
- Program Studi Diploma Tiga (III) Akuntansi.
Masing-masing Program Studi dipimpin oleh Ketua Program Studi. Penyelenggaraan pendidikan untuk Program Studi Diploma IV Akuntansi diselenggarakan di Kantor Pusat Badan Pendidikan dan Pelatihan Keuangan, Jl. Purnawarman No.99 Jakarta Selatan. Sedangkan penyelenggaraan pendidikan untuk Program Studi Diploma III Akuntansi diselenggarakan di Kampus PKN STAN.
Diawal berdirinya, Bapak Soffan Marsus ditunjuk sebagai Ketua Program Studi Diploma IV Akuntansi, sedangkan Bapak Andy P. Hamzah ditunjuk sebagai Ketua Program Studi Diploma III Akuntansi.
2. PAJAK
Jurusan Pajak Politeknik Keuangan Negara (PKN) STAN dipimpin oleh Ketua Jurusan. Jurusan Pajak memiliki 3 (tiga) Program Studi unggulan, yaitu :
- Program Studi Diploma Tiga (III) Pajak;
- Program Studi Diploma Tiga (III) Pajak Bumi dan Bangunan/Penilai; dan
- Program Studi Diploma Satu (I) Pajak.
Masing-masing Program Studi dipimpin oleh Ketua Program Studi. Penyelenggaraan pendidikan untuk Program Studi Diploma III Pajak dan Program Diploma III Pajak Bumi dan Bangunan/Penilai diselenggarakan di Kampus PKN STAN. Sedangkan untuk Program Studi Diploma I Pajak, selain diselenggarakan di Kampus PKN STAN, juga mengambil tempat di 11 Balai Diklat Keuangan yang tersebar di kota-kota besar di Indonesia.
Diawal berdirinya, Bapak Rahmad Utomo ditunjuk sebagai Ketua Program Studi Diploma III Pajak, Bapak Eri Wahyudi ditunjuk sebagai Ketua Program Studi Diploma III Pajak Bumi dan Bangunan/Penilai, dan Bapak Agus Bandiyono ditunjuk sebagai Ketua Progrm Studi Diploma I Pajak.
3. KEPABEANAN DAN CUKAI
Jurusan Kepabeanan dan Cukai Politeknik Keuangan Negara (PKN) STAN dipimpin oleh Ketua Jurusan. Jurusan Kepabeanan dan Cukai memiliki 2 (dua) Program Studi unggulan, yaitu :
- Program Studi Diploma Tiga (III) Kepabeanan dan Cukai; dan
- Program Studi Diploma Satu (I) Kepabeanan dan Cukai.
Masing-masing Program Studi dipimpin oleh Ketua Program Studi. Penyelenggaraan pendidikan untuk Program Studi Diploma III Kepabeanan dan Cukai diselenggarakan di Kampus PKN STAN. Sedangkan untuk Program Studi Diploma I Kepabeanan dan Cukai, selain diselenggarakan di Kampus PKN STAN, juga mengambil tempat di Balai Diklat Keuangan yang tersebar di kota-kota besar di Indonesia.
4. MANAJEMEN KEUANGAN
Jurusan Manajemen Keuangan Politeknik Keuangan Negara (PKN) STAN dipimpin oleh Ketua Jurusan. Jurusan Manajemen Keuangan memiliki 3 (tiga) Program Studi unggulan, yaitu :
- Program Studi Diploma Tiga (III) Kebendaharaan Negara;
- Program Studi Diploma Tiga (III) Manajemen Aset; dan
- Program Studi Diploma Satu (I) Kebendaharaan Negara.
Masing-masing Program Studi dipimpin oleh Ketua Program Studi. Penyelenggaraan pendidikan untuk seluruh Program Studi Diploma di bawah Jurusan Manajemen Keuangan diselenggarakan di Kampus PKN STAN.
Diawal berdirinya, Bapak Budi Mulyana ditunjuk sebagai Ketua Program Studi Diploma III Kebendaharaan Negara, Bapak Pratin ditunjuk sebagai Ketua Program Studi Diploma III Manajemen Aset, dan Bapak Budi Waluyo ditunjuk sebagai Ketua Progrm Studi Diploma I Kebendaharaan Negara.